​​Στον Υμηττό απαντώνται 654 είδη φυτών, 40 εκ των οποίων είναι ενδημικά της Ελλάδας, αρκετά από τα οποία είναι προστατευόμενα με διεθνείς συνθήκες. Το βουνό παρουσιάζει μεγάλη ποικιλία οικοσυστημάτων από δάση κωνοφόρων και άλλων ειδών υψηλών δένδρων μέχρι οικοσυστήματα αειφύλλων πλατυφύλλων και αγρούς. Όλα τα οικοσυστήματα είναι εξίσου σημαντικά παρά το συχνό σφάλμα να θεωρούνται εκτάσεις χαμηλής βλάστησης (σχίνων, πουρναριών, κλπ) ως υποβαθμισμένες.

​

Αξίζει να σημειωθεί ότι στον Υμηττό φύονται 44 είδη άγριας ορχιδέας, αποτελώντας μια από τις μεγαλύτερες συγκεντρώσεις τόσων ειδών αυτού του φυτού, στην Ευρώπη, σε σχέση με την έκταση του βουνού. Ορχιδέες όλων των σχηματισμών και χρωμάτων, απαντώνται σε ολόκληρο το βουνό και ο νότιος Υμηττός δεν αποτελεί εξαίρεση. Συνήθως όμως, οι ορχιδέες βρίσκονται μακριά από τα πολυσύχναστα μονοπάτια και τους δρόμους, όπου η ομορφιά τους τις καθιστά εύκολο θύμα του ανθρώπου που τις αφαιρεί για την αισθητική τους αξία.

​

Πέρα όμως από την αξιοσημείωτη συγκέντρωση ειδών ορχιδέας ο Υμηττός φιλοξενεί και άλλα ιδιαίτερα είδη φυτών σε ορισμένα από τα οποία έδωσε και το όνομά του. Αυτά είναι το ηλιάνθεμο του Υμηττού (Helianthemum hymettium) που αν και δεν είναι σπάνιο ή απειλούμενο εντυπωσιάζει με το μικρό του μέγεθος και το φανταχτερό χρώμα του και η σκαμπιόζα του Υμηττού (Scabiosa hymettia), ένα εντυπωσιακό στην εμφάνιση και σπάνιο φυτό, το οποίο οι επιστήμονες αρχικά θεωρούσαν ενδημικό του Υμηττού, όμως αργότερα ανακαλύφθηκε και σε άλλα μέρη της χώρας μας.

​

Όσον αφορά τα δάση του βουνού αυτά είναι κυρίως δάση Χαλεπίου Πεύκης (Pinus Halepensis), όπως και τα περισσότερα δάση